a reculée du Lison est située à l'ouest du département du Doubs, à 18 km au sud de Besançon et à 10 km au nord-est de Salins-les-Bains. Très sinueuse, elle est longue de plus de 21 km avec une orientation générale nord. Sa largeur moyenne est de 700 m et sa profondeur varie entre 150 et 300 m avec une moyenne de 200 m. La reculée débute au niveau de la source du Lison, à 1,5 km au sud-est de Nans-sous-Sainte-Anne, et se termine à la confluence entre le Lison et la Loue sur le territoire des communes de Châtillon-sur-Lison et de Lizine, où elle débouche sur la reculée de la Loue

n raison de la proximité des caractéristiques de la reculée du Lison avec celle de la Loue, elle est considérée par les géologues comme étant sa « petite sœur ». Elle traverse sur les deux premiers kilomètres de son parcours le faisceau salinois, puis incise le plateau d'Ornans-Amancey jusqu'à son débouché. La reculée du Lison est creusée « en étoile », chaque affluent passant par les roches tendres du plateau d'Ornans-Amancey et du faisceau salinois. Les méandres parfois serrées du tracé de la reculée démontrent que le Lison s'est enfoncé dans le plateau lors de l'élévation de ce dernier. Dans le plateau, les calcaires du Jurassique moyen affleurent en escarpement et sont séparés par des versants moins abrupts constitués d'éboulis. Dans le faisceau, les ruisseaux en amont du Lison forment des canyons qui incisent les calcaires du Jurassique supérieur, puis la vallée s'élargit en étoile irrégulière après la source de la rivière dans un relief plus chaotique avec des dénivelées de plus de 400 m entre les sommets et les dépressions